Sinopsis

Setelah perang dahsyat melawan ras raksasa yang dikenal sebagai Zentradi, umat manusia telah melarikan diri menuju pusat galaksi dengan menggunakan armada kapal kolonial bernama Macross Frontier. Seiring ancaman ekstraterestrial semakin jauh tertinggal, kehidupan di Macross Frontier berjalan seperti biasa. Pada tahun 2059, seorang calon pilot mecha muda bernama Alto Saotome dan rekan-rekannya sedang bersiap untuk menampilkan pertunjukan pengiring bagi penyanyi terkenal Sheryl Nome, yang datang ke Macross Frontier untuk sebuah konser. Selama pertunjukan, spesies alien biomekanik yang dikenal sebagai Vajra tiba-tiba muncul, menerobos perimeter pertahanan yang mengelilingi kapal dan mendarat darurat di dekat tempat konser, menjerumuskan seluruh kota ke dalam kekacauan. Saat para penonton konser dievakuasi, seorang gadis muda bernama Ranka Lee tertinggal dan menjadi sasaran Vajra, tetapi ia diselamatkan pada menit terakhir oleh Alto. Setelah peristiwa ini, program Layanan Militer Strategis mencatat keahlian Alto dalam pertempuran, yang mengakibatkan perekrutannya untuk memerangi ancaman alien baru tersebut.